No ano 2000, Sua Alteza Aga Khan iniciou o estabelecimento de uma rede integrada de escolas, denominada por Academias Aga Khan, dedicada à expansão do acesso à educação internacional de excelência.   As Academias, que educam jovens homens e mulheres da pré-primária até ao ensino secundário, estão planeadas em locais-chave como na África, Ásia Central e do Sul, e no Médio Oriente.   A primeira Academia Aga Khan abriu em Mombaça, Kenya em Agosto 2003.   A segunda, em Hyderabad, India, iniciou a operação em 2011 e a terceira Academia Aga Khan abriu em Maputo, Moçambique em 2013