ستتولى مؤسسة الآغا خان تنفيذ ثلاثة مشاريع في أفغانستان من خلال اتحاد يجمعها مع منظمة الصحة العالمية واليونيسف. هذا وتهدف تلك المشاريع إلى تعزيز قدرة الأنظمة الصحية على تقديم الاستجابة، وإجراء اختبارات للمرضى وتقديم العلاج لهم، فضلاً عن تحسين الوقاية من العدوى، وزيادة نسبة الوعي، إلى جانب الحد من المخاطر التي تشكلها بعض الأغذية. وسيتم دعم المشاريع الثلاثة عبر منحة قدرها 35 مليون يورو من الاتحاد الأوروبي.

أنشأت منظمة أوكسفام ومؤسسة الآغا خان خمسة مراكز لتنمية الطفولة المبكرة في طاجيكستان، وذلك في محاولة منها لزيادة عدد مراكز تنمية الطفولة المبكرة والمساهمة في تنفيذ البرامج التعليمية الوطنية.